כפי שאמרנו, אימונולוגיה היא תחום ביולוגי המתפרס על פני ענפי מחקר רבים, ולמעשה נוגע כמעט לכל בעיה רפואית קיימת. הסיבה לכך היא שאימונולוגיה עוסקת במערכת החיסון על הרכבה, תאיה, אבריה ותפקודיה, אותם נתאר בהמשך. כמו כן, העוסקים בה עמלים על פיתוח חיסונים, התמודדות עם בעיות שונות כמו אלרגיות, דחייה של שתלים, מחלות שבהן תוקפת מערכת החיסון רקמות בגוף (אוטואימוני), ועוד כשלים שונים. מלבד זאת, תחום האימונולוגיה עוסק בהיבטים רבים נוספים כמו פיתוח החיסונים שכב ציינו, תרופות מונחות ונוגדנים, ריפוי גנטי, שתלים, והגנה על מרכיבי מערכת החיסון מפני חדירתם של נגיפים.
תפקידה המרכזי של מערכת החיסון (בה עוסקת כאמור האימונולוגיה), הינו לסייע במלחמה נגד גופים זרים כמו חיידקים, וירוסים וזיהומים אחרים, המנסים לחדור אל הגוף ועלולים לפגוע בו. רוב הזמן איננו נותנים את הדעת על פעילותה של מערכת זו מהסיבה הפשוטה שהיא מתפקדת באורח תקין, ואנו נזכרים בה רק בעת מחלה. ואולם, כאשר מתעוררים בה כשלים מהותיים כמו חולשה או תגובת יתר, עלינו לקבל טיפול רפואי ייחודי מטעם אימונולוגים קליניים – שעליהם נספר בהמשך. לעת עתה, הבה נבחן מספר איברים ומרכיבים השותפים לפעילותו של המערך החיסוני בגוף. הראשון שבהם הוא הלימפה, מערכת שתפקידה לדאוג לניקיון והזנת הרקמות, ולאחסן תאי דם לבנים מסוגים שונים. תאים אלו מהווים בפני עצמם חלק מהותי מהמערך החיסוני, ומתחלקים בעיקר לסוגי B ו- T. הסוג הראשון דואג לכך שיישאר לגופנו זיכרון של התמודדות עם פתוגנים, כך שיוכל להגיב ביתר יעילות כנגדם, ואילו הסוג השני מבצע את המלחמות עצמן.
כפי שאמרנו, ישנם מצבים מסוימים בהם יש לפנות לאבחון וטיפול רפואי עקב כשלים במערכת החיסון, למשל אם היא תוקפת את הגוף וגורמת למחלה אוטואימונית או לאלרגיה, או כשהיא חלשה מדי ונוצרת בעיה להתמודד עם זיהומים. במקרים אלו יש לפנות בהתאמה אל אימונולגים קליניים או לרופאים המכונים אלרגולוגים, המתמחים באופן ספציפי באלרגיות. מדובר ברופאים שסיימו את לימודי הרפואה הכלליים במשך כשש שנים, ולאחר מכן המשיכו להתמחות ברפואה פנימית ובאימונולוגיה. התמחותם מאפשרת להם לאבחן ולטפל בבעיות שמקורן במערכת חיסון כושלת, כמו אסתמה, דלקת מפרקים שגרונית, אלרגיה לאבקני פרחים, וכשלים חיסוניים עקב נטילת תרופות. יש לציין כי רופאים אלו עובדים במרבית המקרים בבתי החולים, וחלקם גם משמשים במוסדות אחרים המבצעים מחקרים ופיתוחים של תרופות, חיסונים והתערבויות רפואיות נוספות.